Jag skulle börja med att kolla i ljudinställningarna i Logic, och se vad som är inställt där.
Jag vet att det ibland kan strula med det interna ljudkortet eftersom det delar på högtalarna och ljudutgången, vilket ibland kan förvirra program. (Men Logic borde ju klara det, tycker man.)
I annat fall kan du testa om du får ljud ur tex Garageband eller något annat ljudprogram, funkar det så är det någon inställning i Logic som strular.