Nej det går inte spec mycker långsammare, dock beror det mer på vilken maskin du har än på FileVault.
Dock kommer du nog stöta på patrul med att kryptera din hemmakatalog med TrueCrypt, om jag inte minns helt fel så kan du välja i TrueCrypt att kryptera hela disken eller en mapp. Problemet med din hemmakatalog är dock att det där finns saker som systemet behöver för att kunna logga in dig ordentligt osv, så om du krypterar den måste du på ngt sätt få truecrypt att avkryptera mappen innan du loggar in vilket blir ett fint höna & ägg problem om du inte vill ha mappen okrypterad så länge som datorn är på (vilket jag misstänker du inte vill).
Detta löser ju FileVault genom att vara en transparent del av inloggningen, vilket inte truecrypt är.