All metadata sparas mig veterligen i biblioteks-databasfilerna (de som ligger inuti paketet "iPhoto Library").
Genom att börja med ett tomt bibliotek har du börjat med ett bibliotek utan din information. Utan iPhoto-bibliotekets filer, är dina bilder bara rena bilder (såvida du inte använder något program som lagrar info i själva bilderna).
De .plist-filer som ligger i Preferences innehåller inte information om dina bilder, utan bara inställningarna i själva programmet.
Det bästa är nog om du går tillbaka till det bibliotek du hade innan, där all info fanns kvar. Sedan kryssar du i rutan om att allt i fortsättningen ska kopieras automatiskt till biblioteket. Och de bilder som du har i en separat mapp sedan tidigare, låter du ligga kvar där, så att inte iPhoto tappar bort dem.
Om du verkligen inte vill ha bilderna i en separat mapp längre, tror jag du kan använda Exportera-funktionen för att få med nyckelorden ut.
Om du i iPhoto markerar de bilder som härstammar från den separata mappen och sedan väljer Exportera från Arkiv (och sedan Exportera filer). Då kan du kryssa i att nyckelord ska tas med vid exporten. De filer som då skapas borde ha nyckelorden inbakade i själva bildfilerna – så när du importerar dem i iPhoto (eller vilket program som helst) igen, kommer denna information med.
OBS: Sålänge du inte rör dina filer manuellt efter att de är importerade, utan låter iPhoto sköta dem, kommer ingenting bli problematiskt eller försvinna.